Bakteriophagen-vermittelte Störung der Bakteriengemeinschaften im menschlichen Darm
2022
University of California, La Jolla, USA
Das Ziel dieser Studie war die Untersuchung von Bakteriophagengemeinschaften, die sich im menschlichen Magen-Darm-Trakt vermehren. Dafür wurde eine Methode zur Manipulation der Phagen-Bakterien-Dynamik mithilfe eines In-vitro-Bioreaktormodells des distalen menschlichen Darms entwickelt. Definierte bakterielle Gemeinschaften, die eine Untergruppe von Bakterien im Stuhl zweier menschlicher Individuen darstellen, wurden hergestellt und in Bioreaktoren kultiviert. Die Parameter des Bioreaktors wurden so eingestellt, dass sie die Physiologie des menschlichen Dickdarms nachahmen. Der pH-Wert wurde bei 7,0 gehalten, die Temperatur bei 37°C und anaerobe Bedingungen wurden aufrechterhalten. Darüber hinaus wurden Methoden zur Reinigung der mit jeder kultivierten Bakteriengemeinschaft verbundenen Virengemeinschaften, den sogenannten Viromen, entwickelt und ein System zur Übertragung lebender oder durch Hitze abgetöteter Viren zwischen Bioreaktoren getestet, um die Folgen virusvermittelter Störungen zu entschlüsseln.
Es wurde festgestellt, dass übertragene Virome durch metagenomische Sequenzierung vor dem Hintergrund des ursprünglichen Viroms nachweisbar waren und dass Veränderungen in der Diversität und Zusammensetzung der Bakteriengemeinschaft im Zusammenhang mit der Zeit nach der Behandlung erkennbar waren. Diese Studie unterstützt den Einsatz von Bioreaktoren als Plattform für die Untersuchung komplexer Bakterien-Phagen-Dynamik.
Bacteriophage-mediated perturbation of defined bacterial communities in an in vitro model of the human gut
David Pride
Eingestellt am: 03.07.2023
[1] https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.01135-22
