Computermodellierungsansatz zur Simulation von Proteinwechselwirkungen
Oktober 2022
The University of Kansas, Lawrence, USA
Fortschritte in der computergestützten Modellierung haben zu einer zunehmenden Konzentration auf größere biomolekulare Systeme bis hin zur Ebene einer Zelle geführt. Proteininteraktionen sind ein zentraler Bestandteil zellulärer Prozesse. Techniken zur Modellierung von Proteininteraktionen wurden in zwei Bereiche unterteilt: Protein-Docking (Vorhersage der statischen Strukturen von Proteinkomplexen) und molekulare Simulation (Modellierung der Dynamik der Proteinassoziation für relativ kurze Simulationszeiten bei atomarer Auflösung). Diese Studie wurden die beiden Ansätze kombiniert, um sehr lange Simulationszeiten zu erreichen. Die Studie macht das Modell geeigneter für reale Zellen und zur Erforschung zellulärer Prozesse mit atomarer Auflösung. Dadurch hilft sie, die molekularen Mechanismen des Lebens besser zu verstehen und dieses Wissen zu nutzen, um unsere Möglichkeiten zur Behandlung von Krankheiten zu verbessern.
Docking-based long timescale simulation of cell-size protein systems at atomic resolution
Ilya A. Vakser
Eingestellt am: 24.10.2022
[1] https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2210249119[2] https://www.drugtargetreview.com/news/105601/powerful-computer-modelling-approach-developed-to-simulate-cells/?utm_source=Email+marketing&utm_medium=email&utm_campaign=DTR+-+Industry+Insight+-+Thermo+Fisher+-+Informatics+-+14.10.2022&utm_term=Using+computational+modelling+to+gain+insights+into+flu+viruses&utm_content=https%3a%2f%2femails.drugtargetreview.com%2frussellpublishinglz%2f&gator_td=IUcSF6GWjJ6XMiIK0E97KpsRmIMCn%2f3gtYslFGn%2bECZbVO5xEN0hnuoDQucMncTwUCbpxQ9igcloo1zWJDmJwawBH9xJljYT25yFbhwBnH7foAwfmsv9lPb4%2bnhFzfQASJmGkBTLX43Ou2MFZqck8xGJ9ka%2bQZsR12tZBWVCv4%2bCV1mUM8L3DGV6R%2bk%2bOdJ1SOFjTih3Wk1yCVCpcIcRlMSDXv8X%2b89U4ekc2SsmwDReETvzp%2bMHcRO7wJtasBxsL5hfJOFa7vCtCtR0N6TT5Q%3d%3d
