Neue KI-Methode könnte die Entwicklung von T-Zell-basierten Krebstherapien unterstützen
2021
MD Anderson Cancer Center, Houston, USA(1)
University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, USA(2)
University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, USA(2)
In dieser Studie haben die Forscher eine Technik mit künstlicher Intelligenz (KI) entwickelt, die erkennen kann, welche von Neoantigenen produzierten Zelloberflächenpeptide vom Immunsystem erkannt werden. Durch die Anwendung dieser pMTnet genannten Methode auf humane Tumorgenomdaten stellten die Autoren fest, dass Neoantigene im Allgemeinen immunogener sind als Selbstantigene, aber dass das humane endogene Retrovirus E (eine spezielle Art von Selbstantigen, das bei Nierenkrebs reaktiviert wird) stärker immunogen ist als Neoantigene. Sie fanden außerdem heraus, dass Patienten mit stärker klonal expandierten T-Zellen, die eine bessere Affinität zu trunkalen statt zu subklonalen Neoantigenen aufweisen, eine bessere Prognose und eine bessere Therapiereaktion auf die Immuntherapie bei Melanom und Lungenkrebs, aber nicht bei Nierenkrebs aufwiesen. Somit könnte pMTnet zu neuen Wegen zur Vorhersage der Krebsprognose und des möglichen Ansprechens auf Immuntherapien führen, die zur Entwicklung von Behandlungen wie Krebsimpfstoffen und T-Zell-basierten Therapien beitragen können.
Deep learning-based prediction of the T cell receptor–antigen binding specificity
Alexandre Reuben(1), Tao Wang(2)
Eingestellt am: 23.02.2022
[1] https://www.nature.com/articles/s42256-021-00383-2[2] https://www.drugtargetreview.com/news/97403/new-ai-method-could-aid-in-development-of-t-cell-based-cancer-therapies/?utm_source=Email+marketing&utm_medium=email&utm_campaign=DTR+-+Industry+Insight+-+Thermo+Fisher+-+Informatics+-+19.11.21&utm_term=New+AI+technology+could+shape+the+future+of+RNA+therapeutics&utm_content=https%3a%2f%2femails.drugtargetreview.com%2frussellpublishinglz%2f&gator_td=Cwthm19KYaLKdDoL1rWudvLnht2Dws%2fbFsgEvlhM3rggV7N67epc45IYoHcBSrz0jchdfUZqCyw%2bWNkCaIelSwsxn0kBQQKvNuj9wL1qIkSwyC3HS2fWrlyxAduZw%2fmqW8sOg874fiDhxhovX5msWtsyFuicujiksLRIO%2f6CPAJtCWEAwrvOj%2fnkLUpBfJU9DsjAGHlwFGZcSEwy167MMRKETFKkPbsrKVbYsyDV%2fUlMx23ciiFuuwqRASOdfOeXT05rXhBh6Dl545N4RkHNdw%3d%3d
