Computergestützte Entschlüsselung von Tumorsequenzierungsdaten
2014
University of California, Irvine, USA
Zwei Arten von Sequenzierungsinformationen werden kombiniert, um die Identifizierbarkeit von Daten zu verbessern, die bestimmten Tumorzellen oder subklonalen Typen zugeordnet sind. Diese Methode, die in einem Python-Paket mit dem Namen PyLOH verfügbar ist, ist in der Lage, bestehende Methoden zu übertreffen, wenn sie sowohl in simulierten Daten als auch in realen Brusttumordatensätzen verwendet wird. Sie kann daher ein nützliches Instrument zur Lösung der Subklassifizierung von Sequenzierungsdaten in gemischten Tumorzellpopulationen sein.
Deconvolving tumor purity and ploidy by integrating copy number alterations and loss of heterozygosity
Xiaohui Xie
Eingestellt am: 28.07.2021
[1] https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/15/2121/2390232[2] https://data.jrc.ec.europa.eu/dataset/ffebe454-ed9a-47cf-8a33-8cf70c1b7d38
